浙江代谢组学定量方法

土壤代谢组学：银纳米颗粒（AgNPs）是使用*****的工程纳米材料之一，泄露可能导致颗粒在土壤中积累，并对环境造成未知风险。有报告指出AgNPs可能通过影响根系分泌物间接对微生物群落功能和基因组多样性产生***影响，但对其机理了解甚少。土壤代谢物可作为土壤微生物群落变化的表型特征，但当前有关NPs暴露对土壤微生物群落影响的研究不包括对土壤代谢产物的分析。16S rRNA基因序列可以提供改变的土壤微生物群相关信息，鉴于它们的已知功能，人们可以对土壤生物化学的变化提出合理假设。本文作者利用16S rRNA基因测序和非靶向代谢组学方法，研究了AgNPs对土壤微生物群落的长期影响。靶向代谢组学、非靶向代谢组学在线咨询。浙江代谢组学定量方法

微生物组和代谢组学结果表明，高比例的直链淀粉/支链淀粉比例能够调节消化和粘膜相关的盲肠微生物群落和代谢特征。三种比例中，喂养含有50%高直链淀粉的饮食具有更好的结果，因为其共生细菌（如Akkermansia，Lactobacillus和Faecalibacterium）的富集，戊酸盐的增加以及促炎细胞因子的减少。代谢组学结果显示盲肠组织的代谢特征发生了改变，包括脂质肉碱和α-生育酚等代谢物的上调和下调。这些发现为直链淀粉/支链淀粉的比例是如何通过调节微生物发酵，导致共生微生物群和代谢物的增殖，从而改善断奶山羊的盲肠环境提供了新的见解。本篇文章，检测了喂食不同直链淀粉/支链淀粉比例的山羊的盲肠中SCFAs和炎症因子的变化，并使用16s RNA测序检测了不同组山羊的盲肠粘膜和消化物中微生物的变化，找到了变化的优势菌群以及菌群和SCFAs的相关性。再使用LC-MS/MS非靶代谢组学研究了不同组山羊盲肠组织的代谢物变化。通过多组学结合的方式，揭示了不同比例的直链淀粉/支链淀粉对山羊盲肠环境的影响。北京微生物组学 代谢组学公司非靶向代谢组学，靶向代谢组学研究经验。

微生物16S rRNA测序+代谢组学研究：标题：EphB6缺陷小鼠的肠道菌群通过介导维生素B6动态平衡调节孤独症行为期刊：MicrobiomeIF=14.650研究思路：*样本类型：小鼠粪便、脑组织*检测平台：LC-MS非靶向代谢组、16S微生物多样性检测自闭症谱系障碍（ASD）是一种发育障碍，目前对孤独症的**症状的有效***很有限。ASD患者临床研究证据表明，肠道菌群与ASD发展之间存在联系，但肠道菌群与ASD的脑功能障碍（肠脑轴）联系机制尚未完全阐明。在肠道稳态起着重要作用的EphB6基因（位于7q号染色体，属于受体酪氨酸激酶Eph家族），因基因突变和在ASD患者中表达下调，被认为是ASD的候选基因。但尚不清楚EphB6在调节肠道菌群和ASD发生的作用机制。本研究中作者发现EphB6在功能上与ASD相关，并通过肠道菌群介导的维生素B6和多巴胺，调节患者自闭症样行为。作者建立了EphB6缺陷小鼠肠道菌群失调与内侧前额叶皮层（mPFC）（关键的肠脑功能轴）的兴奋/抑制失衡之间的功能联系。

GC-MS非靶向代谢组学研究：不同分子量聚乙烯颗粒改变了玉米根际土壤微生物群落组成和代谢谱AlterationsoftherhizospheresoilmicrobialcommunitycompositionandmetaboliteprofilesofZeamaysbypolyethylene-particlesofdifferentmolecularweights研究对象：聚乙烯颗粒、玉米、根际土壤发表期刊：JournalofHazardousMaterials影响因子：10.588组学技术：GC-MS非靶向代谢组学和16SrRNA测序(由欧易/鹿明生物提供技术支持)；这项研究的重点是确定不同分子量的PE颗粒干扰玉米生长和根际微环境的机制。本文运用非靶向代谢组学，微生物16SrRNA测序等方法研究的结果证实，不同分子量的PE颗粒对土壤-植物系统有不利影响。不同分子量的PE颗粒在形状和表面微观结构上存在明显差异。土壤蔗糖酶和过氧化物酶对不同分子量的PE颗粒有***响应。非靶向代谢组学数据分析 靶向代谢组学数据分析。

本研究通过LC-MS和GC-MS双平台代谢组学研究方法，对92例样品5个时间点的尿液样品进行分析，分别找到了33种和155种与PM和生物气溶胶相关的差异标志物，结果揭示了年轻健康人在五个不同时间点的尿液代谢谱的动态变化，采用KEGG通路富集分析和时间序列分析确定了与短期共同暴露于空气中PM和生物气溶胶相关的几种潜在代谢物生物标志物，发现短期高浓度暴露于PM可能会导致代谢改变并降低应激***水平，这可能是与下丘脑-垂体-肾上腺和交感-肾上腺-髓质轴的***有关；而生物气溶胶剂则通过***系统对病理性成瘾有重要作用。其中尿液中的16-脱氢孕酮可能是PM暴露的潜在生物标志物；4-羟基苯乙醇可能是生物气溶胶的潜在生物标志物，可用于分别预测或诊断PM或生物气溶胶相关疾病。**话代谢、代谢组学实验设计、数据解读分析、数据库介绍及使用流程。江苏营养代谢组学

代谢组学-对生物体内所有代谢物进行定量分析。浙江代谢组学定量方法

代谢组学数据提供了COVID-19患者各阶段循环代谢物特征的综合观点，并确定了葡萄糖代谢和尿素循环的代谢重编程是COVID-19的潜在病理机制。在****病程的不同阶段，靶向宿主代谢可能是一种可行的方法。非靶向代谢组学分析中，发现队列中的样品共鉴定出2466个代谢物峰，负离子模式631个、正离子模式下的1835个；通过筛选，鉴定出240种代谢物。轻症组的代谢物与正常组部分重合，而重症组和恢复组很容易区分(图1B)。240个代谢物中有193个与COVID-19***相关(图1C)。火山图显示了不同组代谢物与正常组相比上调下调的情况(图1D)；与正常组对比，***上调的代谢物：轻症组有48个，严重组有59个，恢复组有64个；***下调的代谢物：轻症组有33个，重症组有29个，恢复组有34个。使用靶向代谢组学分析；首先根据发现队列中59名受试者的血清代谢物(4个样本因体积小而被排除)；定量到了199种代谢物。根据不同组的浓度，将199个代谢物分为16个簇；然后根据恢复组的代谢物是否恢复到正常水平将这些簇分为三组。浙江代谢组学定量方法

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